Um den erfolgreichen Betrieb des Proton Therapy Center Zürichobersee sicherzustellen, sind Kooperationen mit allen schweizerischen Strahlentherapie- und Onkologiezentren sowohl auf universitärer als auch auf nicht-universitärere Ebene geplant.

Ziel ist es ebenso, mit dem Paul Scherrer Institut in Villigen AG technisch, medizinisch und wissenschaftlich eng zusammenzuarbeiten.